Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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