Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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