Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms