Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms