Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPS29P62273 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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