Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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TM6SF1Q9BZW5 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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