Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ZNF548Q8NEK5 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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