Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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VPS72Q15906 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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VPS72Q15906 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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VPS72Q15906 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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VPS72Q15906 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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