Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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HERC1Q15751 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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HERC1Q15751 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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