Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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