Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms