Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AP3B2Q13367 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms