Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHAF1BQ13112 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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