Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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