Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF888P0CJ79 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF888P0CJ79 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms