Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP17L18D6R9N7 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms