Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM6SF1Q9BZW5 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms