Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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