Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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