Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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LAMA3Q16787 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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