Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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