Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CTF1Q16619 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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