Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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