Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VPS72Q15906 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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