Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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