Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TCOF1Q13428 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCOF1Q13428 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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