Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms