Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
E2F1Q01094 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms