Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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