Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRMP28827 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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