Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRAP18433 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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