Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFTPCP11686 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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