Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms