Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TRIM5Q9C035 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TRIM5Q9C035 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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TRIM5Q9C035 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM5Q9C035 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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