Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PICALMQ13492 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms