Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TCIRG1Q13488 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TCIRG1Q13488 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TCIRG1Q13488 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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