Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ITGB3BPQ13352 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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ITGB3BPQ13352 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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ITGB3BPQ13352 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ITGB3BPQ13352 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ITGB3BPQ13352 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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ITGB3BPQ13352 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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ITGB3BPQ13352 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ITGB3BPQ13352 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms