Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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