Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFFO1Q0D2I5 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms