Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLTCQ00610 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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