Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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