Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms