Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms