Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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