Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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CIPCQ9C0C6 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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CIPCQ9C0C6 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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CIPCQ9C0C6 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CIPCQ9C0C6 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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