Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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