Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms