Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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