Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXD4Q12950 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXD4Q12950 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXD4Q12950 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXD4Q12950 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXD4Q12950 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXD4Q12950 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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