Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms